Agrément CII : la date limite tombe ce mois-ci

Première demande ou renouvellement, l'agrément CII doit être déposé avant le 30 septembre. Délais, dossier à constituer et conséquences d'un retard.

Olivier Equey

Manager en fiscalité de la recherche – France

Publié le: 01/09/2026

5 minutes de lecture


Les DAF qui pilotent plusieurs dossiers de sous-traitance en R&D et innovation doivent tenir compte d’une échéance importante ce mois-ci : les demandes d’agrément CII doivent être déposées avant le 30 septembre afin que les coûts des prestataires puissent être inclus.

Cet article fait le point sur l'échéance du 30 septembre pour l’agrément Crédit d'Impôt Innovation (CII) : ce qu'elle couvre, ce qui distingue une première demande d'un renouvellement, et ce qu'il en coûte de la manquer.

Qu'est-ce que l'agrément CII et pourquoi une échéance unique ?

L'agrément CII est délivré par la direction générale des entreprises. Il atteste qu'un prestataire est en mesure de mener des travaux de conception de prototypes ou d'installations pilotes éligibles au Crédit d'Impôt Innovation pour le compte de tiers.

Sans cet agrément, une entreprise qui sous-traite une partie de son innovation ne peut pas inclure ces dépenses externes dans l'assiette de son CII. Contrairement au CIR, dont l'agrément suit deux fenêtres distinctes selon qu'il s'agit d'une première demande ou d'un renouvellement, le CII regroupe les deux cas de figure dans une seule et même échéance annuelle.

Quelle est la date limite pour un agrément CII ?

Que votre entreprise dépose son dossier pour la première fois ou qu'elle renouvelle un agrément arrivant à échéance, la date limite pour cette année est le 30 septembre 2026.

Seul le contenu du dossier diffère :

  • une première demande doit démontrer, projet à l'appui, la capacité du prestataire à mener des travaux d'innovation conformes aux critères du CII ;
  • un renouvellement doit justifier que cette capacité s'est maintenue sur la période écoulée, généralement à travers les projets effectivement réalisés depuis l'octroi de l'agrément.

Le renouvellement n'est jamais automatique : il suit exactement la même procédure d'instruction qu'une première demande, avec le même niveau d'exigence documentaire.

Contrairement aux échéances de déclaration fiscale, la date limite de l'agrément CII ne dépend pas de la date de clôture de l'entreprise. Le 30 septembre s'applique à tous, quel que soit l'exercice comptable.

Que se passe-t-il si vous manquez la date limite ?

Un dossier déposé après le 30 septembre n'est pas rejeté sur le fond, mais il bascule sur le cycle suivant. Concrètement, les dépenses de sous-traitance facturées par le prestataire pendant l'attente ne peuvent pas être intégrées à l'assiette du CII, ce qui peut représenter un manque à gagner significatif sur un exercice entier.

Pour une entreprise qui découvre l'échéance in extremis, la marge de manœuvre est donc étroite : mieux vaut engager la préparation du dossier plusieurs semaines avant la date limite que de le finaliser dans l'urgence.

Un même sous-traitant pour le CIR et le CII

Un prestataire qui mène à la fois des travaux de R&D et des travaux d'innovation pour le compte d'un même client a souvent besoin des deux agréments à la fois. Il n'est pas nécessaire de mener deux démarches complètement séparées pour y parvenir :

  • il est possible de demander concomitamment les agréments CIR et CII, dans un seul dossier de dépôt ;
  • si le prestataire détient déjà un agrément CIR, il peut obtenir l'agrément CII à sa demande, sans reconstituer de dossier technique spécifique, tant que son agrément CIR reste en cours de validité.

Combiner les deux demandes suppose de respecter la fenêtre la plus contraignante des deux calendriers, celle du CIR, qui se referme le 31 mars, bien avant l'échéance du 30 septembre propre au CII. Un prestataire qui souhaite obtenir les deux agréments dès la même année a donc intérêt à déposer son dossier avant le 31 mars plutôt que d'attendre l'échéance du CII.

Pour l'entreprise donneuse d'ordre, cette articulation compte directement : seules les dépenses facturées par un prestataire agréé pour le dispositif concerné entrent dans l'assiette correspondante. Un sous-traitant agréé uniquement CIR ne permet pas de valoriser la part de ses travaux relevant de l'innovation, et inversement.

Quelle durée avant la prochaine échéance ?

La durée de validité de l'agrément, une fois accordé, n'est pas un chiffre unique. Elle dépend de l'ancienneté du prestataire et de son activité de recherche récente, selon une règle qui s'applique de façon identique aux agréments CIR et CII :

  • l'agrément est accordé pour trois ans dans le cas général ;
  • il n'est accordé que pour un an si le prestataire n'a achevé aucune opération de recherche au cours des douze mois précédant la demande ;
  • à partir de la quatrième demande (soit la troisième demande de renouvellement), l'agrément peut être accordé pour cinq ans, à condition que le prestataire soit agréé de façon continue depuis au moins neuf ans et qu'il ait achevé une opération de recherche dans les douze mois précédant la demande.

Un prestataire qui obtient son agrément CII pour la première fois doit donc anticiper une prochaine échéance dans trois ans, pas cinq, sauf interruption de son activité de recherche l'année précédant sa demande. Ce n'est qu'après plusieurs cycles de renouvellement réussis que l'agrément peut atteindre sa durée maximale.

Bon à savoir

La durée de cinq ans, souvent citée comme référence pour le CII, ne concerne que les prestataires fidélisés depuis longtemps. Un premier agrément, ou un agrément redemandé après une interruption d'activité de recherche, repart systématiquement sur un cycle plus court, ce qui rapproche d'autant la prochaine échéance du 30 septembre.

Comment préparer un dossier solide avant le 30 septembre ?

Le dossier d'agrément CII repose sur une démonstration technique et organisationnelle, pas sur un simple formulaire administratif. Il doit notamment détailler :

  • la nature des projets d'innovation menés ou envisagés, et leur caractère de nouveauté par rapport à l'existant ;
  • les compétences scientifiques, techniques et managériales des équipes affectées à ces projets ;
  • les moyens humains, matériels et organisationnels réellement mobilisés.

Dans notre pratique, les dossiers refusés le sont rarement pour un motif formel : c'est le plus souvent l'insuffisance de la démonstration technique, ou une description trop générique des travaux, qui fragilise la demande. Une présentation plus complète de la procédure d'agrément CIR et CII détaille les pièces attendues à chaque étape.

Combien de temps pour traiter la demande d'agrément ?

Le délai d'instruction d'un dossier d'agrément CII varie fortement selon sa qualité. D'après les délais constatés sur le portail officiel de dépôt, un dossier complet est traité en douze jours seulement dans le meilleur des cas, ou en une vingtaine de jours lorsque l'administration doit échanger avec le prestataire pour obtenir des précisions. À l'inverse, un dossier incomplet ou complexe peut prendre jusqu'à quatre mois à instruire. Cet écart illustre une fois de plus l'intérêt de préparer son dossier bien en amont du 30 septembre plutôt que de le finaliser dans l'urgence.

Points clés à retenir

  • Le 30 septembre est l'échéance unique pour toute première demande ou tout renouvellement d'agrément CII, quelle que soit la date de clôture de l'entreprise.
  • L'agrément CII est valable de un à cinq ans selon votre historique : trois ans dans le cas général, un an sans recherche achevée dans les douze mois précédents, cinq ans seulement à partir de la quatrième demande. Le renouvellement n'est jamais automatique.
  • Un dossier déposé en retard bascule sur le cycle suivant, avec un risque de perte d'éligibilité sur les dépenses de sous-traitance facturées dans l'intervalle.
  • L'agrément CIR suit un calendrier différent (1er janvier-31 mars pour une première demande, 15 août-30 novembre pour un renouvellement) : ne confondez pas les deux échéances.
  • Pour un même sous-traitant, il est possible de demander les agréments CIR et CII ensemble, ou d'ajouter le CII à un agrément CIR déjà détenu sans nouveau dossier technique ; visez la fenêtre du 31 mars si vous voulez les deux dès la même année.

Le calendrier des agréments CIR et CII ne laisse pas de place à l'approximation. Si votre dossier doit être déposé avant le 30 septembre, contactez nos experts pour un diagnostic gratuit et confidentiel.


Nos actualités

Nous contacter

N’hésitez pas à nous contacter pour échanger et voir comment Myriad Consulting peut optimiser et sécuriser vos opportunités de financement R&D.

Contactez-nous