Infrastructures de recherche : financements européens et leviers fiscaux pour l’innovation en 2025

Voici quelques financements pour les infrastructures de recherches en 2025 !

Olivier Equey

Manager en fiscalité de la recherche – France

24/06/2025

5 minutes de lecture


Les infrastructures de recherche jouent un rôle central dans l’excellence scientifique, la compétitivité industrielle et la capacité d’innovation de l’Europe. En 2025, l’Union européenne renforce son soutien à ces infrastructures à travers le programme Horizon Europe, tout en encourageant la mobilisation des crédits d’impôt nationaux pour maximiser l’impact des investissements publics et privés. 

Ce panorama détaille les opportunités de financement, les critères d’éligibilité, les synergies avec les dispositifs fiscaux français et les bonnes pratiques pour réussir dans cet environnement exigeant.

1. Infrastructures de recherche : définition et enjeux stratégiques

Les infrastructures de recherche (IR) englobent les laboratoires, équipements scientifiques majeurs, plateformes technologiques, ressources de données, outils numériques et réseaux ouverts qui permettent aux chercheurs de conduire des travaux de pointe et de répondre aux grands défis sociétaux. 

Elles sont essentielles à la structuration de l’espace européen de la recherche et à la création d’un écosystème ouvert, interconnecté et conforme aux principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).

Les IR couvrent des domaines variés : santé, climat, économie, digitalisation, agriculture, sciences humaines et sociales, etc. Elles favorisent la mutualisation des ressources, l’accès transnational aux installations de pointe et la montée en puissance de la science ouverte.

2. Les financements européens en 2025 : Horizon Europe et appels à projets

Le programme Horizon Europe, doté de 93,5 milliards d’euros pour la période 2021-2027, consacre une part significative à la création, au développement et à la modernisation des infrastructures de recherche. Pour 2025, l’ensemble des appels à projets d’Horizon Europe est doté de 7,3 milliards d’euros, avec des opportunités majeures dans le pilier « Science d’excellence » et des volets spécifiques pour les IR.

Principaux axes de financement :

  • Développement et optimisation du paysage européen des IR : soutien à la création de nouvelles installations, à la modernisation d’équipements et à la consolidation de réseaux existants.
  • Écosystème opérationnel et science ouverte : mise en place de plateformes numériques, de clouds européens pour la gestion et le partage des données scientifiques (EOSC).
  • Accès transnational : financement de la mobilité des chercheurs et de l’accès à des installations de pointe, pour renforcer la coopération et la circulation des compétences.
  • Nouvelle génération d’instruments et de méthodes : soutien à l’acquisition d’équipements innovants, à l’intelligence artificielle, à la robotique, et au développement d’outils numériques avancés.
  • Co-création et impact sociétal : financement de feuilles de route technologiques et de projets collaboratifs impliquant plusieurs partenaires européens, avec des subventions allant jusqu’à 10 millions d’euros par projet.

Les appels à projets sont ouverts à tous les acteurs de la recherche et de l’innovation : universités, centres de recherche, entreprises, collectivités, associations, avec une forte incitation à la collaboration transnationale.

3. Synergies avec les crédits d’impôt français

Les financements européens peuvent être combinés avec les dispositifs fiscaux nationaux pour maximiser l’effet de levier des investissements, sous réserve du respect des règles de cumul et de non-double financement.

  • Crédit d’Impôt Recherche (CIR) : les dépenses de R&D engagées dans le cadre de projets d’infrastructures de recherche peuvent être éligibles au CIR, notamment pour le développement de nouvelles technologies, l’amélioration d’équipements ou la mise en place de plateformes numériques. Le CIR permet de récupérer jusqu’à 30 % des dépenses éligibles.
  • Crédit d’Impôt Innovation (CII) : pour les PME, les dépenses liées à la conception de prototypes ou d’installations pilotes innovantes dans le cadre d’infrastructures de recherche peuvent bénéficier du CII, à hauteur de 20 % des dépenses, dans la limite de 80 000 € par an.
  • Statut Jeune Entreprise Innovante (JEI) : les jeunes entreprises impliquées dans des projets d’infrastructures de recherche peuvent bénéficier d’exonérations sociales et fiscales, sous réserve de respecter les critères d’éligibilité.

Il est essentiel de bien articuler ces dispositifs, de documenter rigoureusement les dépenses et de veiller à la complémentarité des financements européens et nationaux.

4. Critères d’éligibilité et bonnes pratiques

Pour maximiser ses chances de succès, il convient de :

  • Constituer un dossier technique solide : détailler les objectifs scientifiques, les verrous technologiques, la méthodologie, les impacts attendus et la gestion des données.
  • S’appuyer sur des consortiums solides : les projets collaboratifs impliquant plusieurs partenaires européens sont fortement valorisés.
  • Assurer la traçabilité des dépenses : documenter précisément les coûts, l’affectation des ressources et la complémentarité entre financements.
  • Veiller à la science ouverte : intégrer les principes FAIR et la gestion responsable des données dans la stratégie du projet.
  • Anticiper la valorisation des résultats : prévoir des actions de diffusion, de formation et de transfert de technologie pour maximiser l’impact sociétal et économique.

5. Perspectives et tendances pour 2025

L’Europe ambitionne de maintenir son leadership mondial en matière d’infrastructures de recherche, en misant sur l’excellence scientifique, la coopération internationale et l’innovation technologique. Les priorités pour 2025 portent sur la science ouverte, la digitalisation, l’intelligence artificielle, la souveraineté des données et l’impact sociétal des infrastructures. Les financements européens et les crédits d’impôt nationaux constituent un levier puissant pour relever ces défis et accélérer la transformation de l’écosystème de la recherche.

FAQ – Infrastructures de recherche, financements européens et crédits d’impôt

Quels sont les principaux programmes européens pour les infrastructures de recherche en 2025 ?

Horizon Europe, avec ses appels à projets dédiés, soutient la création, la modernisation et la mise en réseau des infrastructures scientifiques sur tout le continent.

Peut-on cumuler subventions européennes et crédits d’impôt français ?

Oui, sous conditions : il faut éviter la double prise en charge des mêmes dépenses et respecter les plafonds d’aides d’État.

Quels types de projets sont éligibles ?

Création ou modernisation de laboratoires, plateformes technologiques, outils numériques, réseaux de données, accès transnational à des installations de pointe.

Quelles sont les bonnes pratiques pour réussir sa demande ?

Valoriser l’excellence scientifique, la coopération européenne, la gestion responsable des données, et la complémentarité entre financements européens et nationaux.

Existe-t-il un accompagnement pour monter un dossier ?

Oui, des webinaires, guides et dispositifs d’assistance sont proposés par la Commission européenne et les agences nationales lors des appels à projets.

Conclusion

Les infrastructures de recherche sont un pilier de l’innovation et de la compétitivité européennes. En 2025, la combinaison des financements européens et des crédits d’impôt nationaux offre un levier exceptionnel pour moderniser les installations, développer la science ouverte et accélérer la recherche collaborative. Une préparation rigoureuse, une veille active sur les appels à projets et une articulation fine des dispositifs fiscaux sont les clés d’une stratégie de financement ambitieuse et durable.

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