Combien coûte un cabinet de conseil pour votre déclaration CIR, CII ou JEI ?

Comparez les honoraires des conseillers en crédit d’impôt recherche (R&D) en France.

Olivier Equey

Manager en fiscalité de la recherche – France

10/10/2025

5 minutes de lecture


Les honoraires des conseillers spécialisés en Crédit d’Impôt Recherche (CIR), Crédit d’Impôt Innovation (CII) et Jeune Entreprise Innovante (JEI), sont souvent un sujet entouré de mystère. Obtenir un devis peut nécessiter de multiples échanges, parfois dans la discrétion, avec différents conseillers, ce qui rallonge le délai de prise de décision alors même que le temps est compté.

Tout cela n’est pas nécessaire, surtout lorsque vous cherchez à prendre une décision éclairée sur un enjeu aussi important que votre déclaration de crédit d’impôt R&D.

Aujourd’hui, l’administration fiscale française demande de plus en plus de détails précis sur les projets, et la vigilance est à son maximum. Il est donc capital d’établir une déclaration correcte dès la première tentative. 

Mais quel prix faut-il payer pour cette tranquillité d’esprit ?

Pourquoi faire appel à un spécialiste du crédit d’impôt R&D ?

Un spécialiste du crédit d’impôt recherche est un professionnel formé et expérimenté, dédié à aider les entreprises à identifier, documenter et déclarer les activités et dépenses éligibles en R&D. Il possède une connaissance approfondie des directives de l’administration fiscale française, assurant ainsi la conformité avec la loi tout en maximisant vos bénéfices fiscaux.

Ce spécialiste vous aide à éviter les deux écueils majeurs : la sur-déclaration (qui peut entraîner des pénalités) et la sous-déclaration (qui vous prive d’argent auquel vous avez droit).

Il existe plusieurs types de spécialistes du crédit d’impôt R&D, avec des bénéfices et des tarifs différents. Les principales options sont :

  • Cabinets spécialisés en fiscalité R&D (pure players)
  • Cabinets d’experts-comptables
  • Outils logiciels et plateformes en ligne
  • Déclarations faites en interne (DIY)

Quels sont les types de prestataires ?

Les honoraires des conseillers peuvent varier significativement selon le modèle de service proposé et la complexité de la déclaration.

Les conseillers spécialisés en crédit d’impôt R&D incluent les cabinets spécialisés et les grands cabinets d’experts-comptables disposant d’équipes dédiées à la finance.

Cabinets spécialisés dans les crédits d’impôt R&D

Honoraires typiques : 10-25 %

Nous parlons ici des cabinets spécialisés dans les crédits d’impôt R&D et parfois d’autres aides à l’innovation sont les plus couramment utilisés. Ces cabinets font des crédits d’impôt R&D leur cœur d’activité : ils connaissent la législation, maîtrisent les déclarations solides et sont familiers des us et coutumes du ministère de la Recherche et de l’Économie.

Ils offrent généralement un service complet : entretiens avec vos équipes, collecte des dépenses, rédaction des rapports, dépôt des dossiers. C’est un service clé en main, mais cette expertise a un coût premium.

La plupart des consultants demandent une consultation préalable pour établir un devis, car chaque dossier est unique. Les honoraires vont donc généralement de 10% à 25 %, avec parfois des options flexibles.

Les meilleurs cabinets sont transparents sur leurs tarifs dès le départ.

Cabinets d’experts-comptables

Honoraires typiques : 5 -15 %

Les cabinets d’experts-comptables proposent parfois des services de crédit d’impôt R&D pour leurs clients innovants. Pour les petits cabinets, cela peut se limiter aux aspects financiers et fiscaux, voire à la simple déclaration. 

Les cabinets plus importants peuvent prendre en charge la déclaration dans son ensemble, au même niveau qu’un cabinet spécialisé.

Il est toujours conseillé de discuter avec votre expert-comptable pour évaluer son niveau d’expertise et sa capacité à préparer ce type de déclaration. Certains sous-traitent la partie technique à des spécialistes, ce qui peut être un avantage en combinant continuité et expertise.

Les petits cabinets proposent souvent des tarifs fixes, surtout s’ils ne gèrent qu’une partie du dossier.

Les cabinets de taille moyenne à grande peuvent avoir des équipes dédiées à la fiscalité R&D, proposant des tarifs proches de ceux des cabinets spécialisés pour un niveau d’expertise comparable.

Les honoraires des conseillers CIR ou CII sont-ils déductibles de l’assiette des dépenses ?

S’ils ont été calculés au pourcentage, oui. Les honoraires versés à un conseiller professionnel pour l’assistance au crédit d’impôt R&D sont généralement déductibles des dépenses éligibles. 

Si les honoraires ont été calculés de manière forfaitaire, alors ceux-ci ne doivent pas être déduits de l’assiette des dépenses éligibles.

Combien coûtent les outils logiciels pour les crédits d’impôt R&D ?

Honoraires typiques : 5-10 % La révolution numérique a frappé les crédits d’impôt R&D avec l’arrivée de solutions en ligne et logicielles. Certaines plateformes proposent un simple modèle à remplir, d’autres s’appuient sur la puissance de l’intelligence artificielle pour vous aider à rédiger votre rapport, et certaines intègrent des experts R&D qui vérifient en coulisses les informations que vous soumettez.

Bon à savoir 💡

Si les outils d’IA sont impressionnants, rappelez-vous que décrire vos projets R&D nécessite une compréhension profonde de votre travail réel - ce qu’aucun chatbot ne peut remplacer.

Il est judicieux de privilégier les plateformes qui combinent technologie et expertise humaine

Les structures tarifaires varient également : pourcentage des gains, prix fixes ou abonnements. La question clé reste : quel support obtenez-vous lorsque les choses se compliquent ? Un contrôle fiscal n’est pas le moment pour découvrir les limites de votre plateforme.

Connaître vos frais à l’avance peut vous aider à décider combien d’efforts vous souhaitez investir dans votre déclaration.

Peut-on faire soi-même sa déclaration de crédit d’impôt R&D ?

Honoraires typiques : Gratuit (hors temps et énergie investis)

Il n’est pas obligatoire de faire appel à un conseiller pour réaliser sa déclaration de crédit d’impôt recherche. 

De nombreuses entreprises la préparent elles-mêmes avec succès. Mais “gratuit” ne veut pas dire sans coût : comptez au minimum 20 heures de travail rigoureux, voire plus si c’est votre première fois.

L’auto-déclaration fonctionne si votre équipe financière possède une solide expérience des crédits d’impôt R&D. Si vous apprenez au fur et à mesure, il faut prendre en compte le risque d’erreurs. Des ressources existent pour vous aider, comme nos ebooks sur le CIR, le CII et le JEI

Avec la vigilance accrue de l’administration fiscale, la marge d’erreur s’est considérablement réduite. Faire sa déclaration soi-même n’est pas une décision à prendre à la légère, mais peut-être une bonne option si vous êtes confiant dans les compétences de votre équipe.

Guide de comparaison rapide:

 

Type de conseiller Fourchette des honoraires Qualité de la déclaration Temps à investir
Cabinets spécialisés 10–25% Élevée 3 à 6 heures
Cabinets d’experts-comptables 5–15% Faible à moyenne Plus de 6 heures
Portails en ligne 5–10% Moyenne à élevée Plus de 10 heures
Autodéclaration (DIY) Gratuit Faible à moyenne Plus de 20 heures

Que faut-il rechercher chez un conseiller en crédit d’impôt R&D ?

Tous les conseillers ne se valent pas. Pour distinguer les professionnels sérieux des opportunistes, voici quelques critères clés à prendre en compte :

Transparence et conditions

  • Ont-ils une structure tarifaire claire et un périmètre de service bien défini ?
  • Que se passe-t-il si votre déclaration est refusée ?
  • Gèrent-ils les contrôles fiscaux ? Cette assistance est-elle incluse dans leurs services ?

Crédibilité et expérience

  • Depuis combien de temps exercent-ils ?
  • Peuvent-ils fournir des avis clients positifs ou des études de cas ?
  • Leur équipe compte-t-elle plus d’experts techniques que de commerciaux ?

Normes professionnelles

  • Sont-ils accrédités par des organismes professionnels reconnus (OPQCM) ?
  • Sont-ils enregistrés auprès de la Médiation des Entreprises,  comme conseillers ?

Red flag à éviter

Évitez tout conseiller qui :

  • Offre des garanties sans comprendre vos projets
  • Vous pousse à déclarer des dépenses que vous savez non raisonnables
  • Ne discute pas clairement de ses honoraires dès le départ
  • Semble davantage vouloir vendre qu’écouter et comprendre votre R&D

L’essentiel  

L’option la moins chère n’est pas toujours la meilleure valeur, surtout lorsqu’une réclamation faible pourrait déclencher un contrôle de conformité coûteux. Concentrez-vous sur la recherche d’un conseiller qui allie des tarifs raisonnables à une expertise avérée et à des pratiques transparentes.


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